在总参谋部负责海军装备建设期间，“昆仑山”级航母是牧浩洋最主要的杰作之一。
从某种意义上讲，“昆仑山”级也是牧浩洋与腾耀辉斗争的结果。
最初的时候，“昆仑山”级被设计成“长江”级的升级替代品，主要针对“长江”级存在的问题进行改进，适当提高作战能力，能够在远离本土的海域独立执行作战任务，降低对后方支援的要求。
“长江”级服役后，情况发生了变化。
虽然在服役期间，“长江”级完全对得起低廉的造价，特别是在不到五万吨的排水量之上获得的强大战斗力，但是对海军来说，中型航母存在的诸对弊端，使其基本上不具备远洋独立作战能力。
在第一次印度洋战争爆发前，这些问题就反映了出来。
受此影响，海军调整了C2，也就是“昆仑山”级的战术指标，明确要求把排水量放宽到八万吨以上。
正是如此，“昆仑山”级成为了大型航母。
在这个阶段，牧浩洋并不反对海军的要求，而是积极支持海军的提议，在“昆仑山”级的招标审议阶段做出了积极贡献。可以说，没有他的支持，黄峙博肯定不会批准海军的“疯狂计划”。
要知道，在设计阶段，“昆仑山”级的造价就是“长江”级的两倍。
相对造价成倍增长，航母的综合作战能力并没成倍增长。说得直接一点，“昆仑山”级的综合作战能力绝对达不到两艘“长江”级之和，而且在作战灵活性上，更是无法与两艘中型航母相提并论。更重要的是，设计阶段只进行造价评估，而实际建造时，造价肯定会有所提高。
可以说，“昆仑山”级只有综合成本上的优势。
说得简单一点，就是在设计的三十五年服役期中，一艘“昆仑山”级的综合开支肯定比两艘“长江”级少得多。别的不说，一艘“昆仑山”级的舰队与航空兵为四千五百人，比两艘“长江”级少了近一千人，三十五年的人员开支就能减少上百亿元，此外维护成本还能节约数百亿元。
在牧浩洋的积极推动下，“昆仑山”级由图纸变成了实物。
只是，在建造数量上，牧浩洋与腾耀辉存在巨大分歧。
前面已经提到，海军最初计划分两批建造八艘“昆仑山”级，将取代“黄帝”号与两艘“长江”级。
显然，这样的“高标准”，不但得不到牧浩洋支持，连黄峙博那关也过不了。
原因很简单，按照腾耀辉提交的计划，第二批“昆仑山”级都将在二零三五年之前建成服役，而“长江”级到此时才服役了不到十五年，没到设计寿命的一半。因为“长江”级是核动力航母，所以不可能出售给其他国家。如果在二零三五年淘汰掉，等于平白无故的损失了几百亿元。
保留两艘“长江”级的话，就没有必要建造八艘“昆仑山”级。
从工业生产角度出发，如果分两批建造八艘“昆仑山”级，则每一批的建造数量都将达到四艘。结果就是，大连造船厂与江南造船厂必须修建第二座船台，需要投入数百亿元的巨额资金。作为企业，两家造船厂不可能为了各建造四艘航母进行如此大的投资，因此要么让海军建造更多的航母，要么让海军分担扩建费用。从成本角度出发，这两种解决方法都会增大海军的负担。
结果就是，牧浩洋坚持先分两批建造四艘。
至于是否建造第三批，与牧浩洋基本上没有什么关系了。
可以说，牧浩洋在处理这件事的时候，非常有远见。
以当时的情况，如果他的提议得到采纳，即便腾耀辉继续坚持主见，也不可能建造第三批“昆仑山”级。原因很简单，等到第二批“昆仑山”级建成，C3项目所需的技术积累基本上完成，海军没有理由建造更多的“昆仑山”级。如果建造C3级，因为采用了大量新技术，特别是采用了新式船体，所以前期最多建造两艘，甚至有可能只建一艘，在取得成功之后再大规模建造。如此一来，即便到二零三五年之后，海军也不会按照腾耀辉的规划大规模建造航母。
当然，这不是说牧浩洋反对建造航母。
只是在他看来，短期内，特别是在解决周边问题之前，中国海军不具备与美国海军进行全球对抗的基础，也就没有必要大规模建造航母，更没有必要在一型航母上花费太大的力气与资源。
按照他的想法，至少在C3级完成之前，中国海军应该保持小步快跑的发展方式。
通过建造多种航母，熟悉航母的建造方式，增强建造工艺，才能打下坚实基础，在技术成熟之后大规模建造。
这是海军发展的必要步骤。
更重要的是，这种发展模式，能够尽可能的利用新技术，更上技术革命的步伐。
在“昆仑山”级航母上，这种发展模式带来的好处体现得非常明确。
比如在“昆仑山”号与“天山”号上，采用了最新研制的防空与末段拦截系统，综合防空能力比“长江”级提高了三倍，末段反导拦截能力更是提高了十倍以上，是当时世界上综合防御能力最强的航母之一。此外还采用了最新研制的电磁弹射器，能在一分钟内弹射五架战斗机。在“秦岭”号与“太行山”号上，通过调整飞行甲板布局，比如把位于右舷的两座升降机的位置向后挪动，使航空出动效率提高了百分之二十，另外还首次配备了最新研制的被动探测雷达。
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