最早回回其实在元朝是属于色目人，后来到了元末时，才算正式有回回，主要就在陕甘宁。
回回其最独特之处就在于他们是以信奉新月教而形成的一个族群，本身其实是由中亚、蒙古、中原等不少族群组成的。
在后来民国的时候，有人曾说回回就是信奉新月教的汉人，其实虽不准确也不是全错，因为在西北，确实是有许多汉蒙等最后因信新月教而成了回回一员。
到了此时，陕甘的回回数量已经很多了，他们跟叶尔羌一样，信奉的是新月教，与信奉藏传佛教的蒙古人不一样，也与汉民不一样。
回回大分散，小聚居。
在元朝灭亡后，回回和蒙古人一样，也有一个逐步内附的过程。在陕甘，回回继续垦荒种地，并不断有归附的回回迁徙过来，人口不断增加。
陕西关中、甘肃河州，宁夏灵州至平凉固原各县，回民众多，形成大量聚居点。
有明一朝，也是回回融合汉蒙等多民族逐渐形成了回回这个新族群。
明初的时候，朱元璋曾经禁止蒙古色目人更易姓氏，也限制回回内部通婚，采取强迫同化的政策，但朱元璋对新月寺和新月教却有谕旨承认保护，这也留下了隐患。
经过近三百年，明初那些在陕甘宁垦田的士兵百姓，已经繁衍生息，有了稳定的聚集区，在这些稳定的居住区，形成了以新月寺为中心的文化习俗，与周围汉人区别越来越大。
明末时，陕北和甘东的回民，就在马守应的率领下，成为农民军的主力之一，在明末的风起云涌中，本就在陕甘宁地方有很强势力的回回，也是迅速的通过组建团练、乡勇，归附新朝等，开始拥有了自己的强力武装，甚至逐渐控制了陕甘许多地方。
朱以海也是早看到了陕甘宁回回与汉人文化习俗相差巨大，而且他们有很强的排外性，在当时的情况下，回回大有几分要在陕甘宁建立一个如叶尔羌汗国一样的政教合一的回国的意思。
朱以海当然不能容忍这种分裂分离势力，所以他并没有一味妥协，而是果断的决定主动挑破脓包。
各地佛道改革，也向陕甘宁下旨，要求奉旨深入推行。
对新教下手，这是最直接的一剑。
尤其是朱以海直接就把新月教定为邪教淫寺，予以取缔禁止，要拆除新教寺庙，收缴焚毁新月教经书，将所有新月教寺的长老们，进行迁移入京畿的政策。
这样激烈的政策，明显是有意激化矛盾的。
而皇帝这样做，也是因为他知道，若是按照许多大臣的建议，对他们采取宽容、缓和的政策，尤其是从俗从宜，务安其俗，那后果历史早就已经演示过了，会非常惨烈的后果。
同治回乱，那是最惨痛的教训，最关键的就是如果完全从俗从宜，那么这样下去，惨事还会重演，甚至可能真要分离出去。
要开扇窗，最后先提出推倒房子。
回回内部，尤其是教宦成为门阀，集教长、地主、先生等角色，成为事实上地方上的话语权掌握者，这些人在地方上，比汉地的那些乡绅们对地方的掌握可强多了，类似于大家族的士绅族长的权威。
教族一体，才是最关键处。
简单的移风易俗，根本是不可能做到的，必须要跟当年大食东进传教时做的那样，才有可能改变。
朱以海故意下旨禁教，迁阿訇教职者入京，整编裁撤陇右回军等，本质就是已经到了不破不立的时候，简单的安抚等已经行不通了。
当尼堪倒下，吴三桂被迫交出兵权进京，御营开进关中后，其实朱以海就已经开始动手了，计划是早就已经深思熟虑了好几年的，如今只是到了动手时机而已。
皇帝不仅仅是针对米喇印丁国栋不听旨意，不肯接受整编，而是要真正的夺回关陇的统治权，族教一体的变绿，将意味着一个回回国在西北建立，这是绝不允许的。
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