王琼的办法其实就是分化了读书人的阵营，用降低成为小吏标准的形势把占了大部分的秀才拉拢到自己这边，然后又给那些有能力通过科举的读书人一个优待，如此一来，大部分读书人得利，小部分的读书人虽然有所不满，但却已经不成气候了。
打破官吏壁垒的阻力虽然被王琼用巧力打破，但是最后一件却是难倒了所有人，这件事就是扩大户部税务司的职权，将各地的税收从衙门中彻底的剥离出来，只要地方官府不再负责收税，那么也就减少了他们贪污的大半机会，毕竟官场上的灰色收入大半都是来自税收，剩下的虽然还有不少其它的门路，但毕竟只是少数。
不过想要将税收的权利从地方官府手中抢过来，这可是一件牵扯极深的事情，毕竟各地的官府早已经将地方税收做为自己的小金库，现在有人想要把这个小金库抢走，那简直就是要他们的命一般，所以这项改革一出，立刻遭到几乎所有地方官吏的反对。
其实这些反对的官员也并不全都是为了给自己谋取私利，有些官员觉得地方税收能够进入官府，并且按照惯例截留一部分，这部分的税收就会成为地方官府的行政资金，日后地方有个什么用钱的地方，也能够方便一些，不需要事事都要向朝廷请示，但现在若是连税收的权力都没有了，他们日后有什么要花钱的地方，都需要向上头请示，这实在太麻烦了。
剥离地方官府税收的权力，这也许是周重改革以来遇到的最大阻力，毕竟所有地方官员都反对，甚至连朝堂上的大臣也不太看好这件事，若是周重强行推行的话，很可能会引起大乱子的，这也让周重为之十分犹豫。
官场本来就是一个不断妥协与被妥协的地方，周重在推行改革之初时，就已经做好了心理准备，他知道自己的设想虽好，但是现实却会让自己的一些设想无法实现，特别是其中牵扯到太多人利益的东西，更是会遭到无数人的反对。也正是在这种情况下，周重与焦芳、王琼等人商议过后，终于对收回地方官府税收权力的改革做了一些修改。
首先税务司的职权还是要扩大的，各个地方都要建立统一的税务机构，由税务司统一管辖，毕竟以前在大明的税收实在是太混乱了，各个地方的苛捐杂税数不胜数，甚至有些地方官员还可以任意增加税收的项目和金额，这不但加重了百姓们的负担，同时也阻碍了商品的流通，因此成立一个统一的税务部门已经成为大明的当备之急，这点周重是绝对不会妥协的。
不过在各地的税务机构成立之后，周重不再要求这些税收机构都独立于行政体系之外，而是依然属于各级官府的下属机构，另外税务司收取的税收除了要上交一定的比例外，剩下的就可以做为各级官府的行政资金，只是想要使用这些资金，各级官府都需要提出申请，列出所需要资金的理由和数额，另外在使用的过程中，也需要有地方的监察御史派人监督，只有这样，才能够保证这些税收不会被乱用。
尽管周重已经退了一步，但是反对这项税务改革的人依然很多，不过这次周重的态度却十分坚决，他以北京、南京和南洋三地为试点，强行将这项改革推行了下去，结果很快就遇到了官场上或明或暗的阻碍，对于这些幕后阻止自己改革的人，周重这次却是下了狠手，当锦衣卫查明了对方的身份，周重用雷霆手段一举抓住了十几个中高级官员，结果这些人除了几个罪行轻一点的被流放外，其它人全都被他一刀斩了。
在这个世界上，想要对一个国家进行改革，不流血是不可能的，虽然周重在改革之前极力想要避免这种情况，但是他却很快发现，自己的退却只会激发对方的嚣张气焰，只有自己表现出足够的强硬，甚至举起屠刀之时，对方才会老老实实的听自己的话。
也正是周重踏着那些滚滚的人头，终于震慑住了那些反对税务改革的官员，使得北京三地的税务改革进行的十分顺利，等到这三地的改革完成后，三地的官场风气也是为之一清，特别是在税收统一之后，三地的百姓明显感觉身上的负担轻了，商人们也惊喜的发现，自己的货物经过三地时，要缴纳的税收也少了许多，而且也少了地方官府的刁难，这种情况让他们感觉自己好像是在做梦一般。
有了这北京这三地的成功案例，周重就更加有底气的在全国推广税务改革，大明的税收总的来说分为两种，第一种是农税，第二种是商税，以前大明的农税是最主要的税收，毕竟大明以农立国，对农业征收的税收也很重，而且农户除了负责税收外，每年还有相应的劳役，说白了也就是免费为官府干活，另外还有一些杂七杂八的税收，都要落到农户身上，可以说繁重的税收正是大明百姓贫穷的根本原因之一。
不过在税务改革之后，农户们就不必再向进行服劳役了，每年虽然也要上缴一定的税收，但相对来说却并不多，至于其它杂七杂八的税收，更是完全被免掉，可以说光是一项改革，就让大明的上亿百姓受益，这也使得税务改革得到了大量百姓们的支持。
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